在講求客戶權益的現代，「服務中斷」是每個企業都無法承受的考驗，更是每個網管人員心中揮之不去的夢魘。但限於人力的考量，網管人員不可能24小時都站在主機前監控系統服務的運作，因此一套能時時監控系統服務，當系統服務發生異常時能夠即時通知管理者的監控系統，將是每個網管人員所迫切需要的。
localhost.cfg
commands.cfg
用來定義指令的行為，須將程式所需參數設定於此：
contacts.cfg
用來定義聯絡人的相關資訊，內容如下：
timeperiods.cfg
可定義規則有效的時間區間資訊，詳細內容如下所示：
resource.cfg
resource.cfg可定義相關變數的資源：
在設定完成組態檔後，可利用指令「nagios -v」來驗證組態檔的參數設定是否正確，如果一切設定無誤，即可啟動Nagios監控主程式。
先執行指令「chown nagios:nagios /usr/local/nagios/」重設Nagios安裝目錄下的檔案權限，以避免權限問題，接著使用指令「/usr/local/nagios/bin/nagios -d /usr/local/nagios/etc/nagios.cfg」以daemon的方式啟動。
安裝Web顯示狀態介面軟體
vshell是Nagios所提供的Web介面軟體（以PHP語言實作），可即時地查看所監看的主機或系統服務的目前狀態。安裝過程相當簡單，先至下列網址取得最新版本的vshell：
下載網頁程式後，直接將程式拷貝至網頁根目錄，並修改constants.inc.php內的STATUSFILE等相關資訊，如下所示（須調整成與Nagios所設定的值一致）：